La Facultad de Agronomía y Sistemas Naturales UC se encuentra en el Campus San Joaquín de la Pontificia Universidad Católica de Chile, en la ciudad de Santiago. Este Campus corresponde al principal centro educacional de esta Universidad, con 50,6 ha y alrededor de 10.000 alumnos de pre y postgrado. Tiene una completa infraestructura para la docencia, extensión e investigación universitaria. Dispone de un importante campo deportivo, bibliotecas, salas de estudios y además dispone de Wi Fi en todo el Campus. Existen librerías, bancos comerciales y otros servicios generales, más un amplio parque de estacionamientos. Cuenta con fácil acceso a través de la línea 5 del ferrocarril metropolitano de Santiago (Metro) y de varias líneas de buses locales. Se encuentra en un área residencial cerca de importantes centros comerciales y de servicio.
La Facultad dispone de tres unidades de laboratorios docentes, salas de computación, de numerosos laboratorios de investigación en diferentes áreas de especialidad y de un laboratorio central de servicios. Dispone de los equipos necesarios para realizar diversos tipos de análisis en apoyo de la investigación y de la docencia de postgrado. Cuenta con aulas y salas de estudio exclusivas para los alumnos del Programa de Postgrado en Ciencias de la Agricultura y acceso a Estaciones Experimentales en las comunas de Pirque, Curacaví y Las Cruces, donde se realizan trabajos de investigación en terreno.
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